El nombre de esta institución fue tomado de la sobrina del cacique Calarcá, el cual pertenecía a la tribu de los pijaos de la cultura de los indígenas Quimbaya, los cuales habitaron en el municipio inicialmente. Este barrio "ciudad boquia" fue fundado el 28 de junio de 1991 con solamente  597 viviendas bajo el gobierno del presidente cesar Gaviria Trujillo.

Se calcula que la población escolar  promedio es de 800 menores  para educación básica primaria , la cual fue una razón de tener dentro del barrio una institución educativa para evitar peligros a los que se exponían los niños al desplazarse hacia otras instituciones y la  erogación de los gastos que esto incluye. Ante esta situación    la junta de acción comunal decidió tomar cartas en el asunto para realizar un proyecto de construcción y dotación de una institución educativa que satisficiera las necesidades de la época.

Este proyecto fue elaborado por la secretaria de educación de Pereira, allí comenzó el  proceso de gestión y dinamismo requerido  para poder dotar la  institución. Se solicitó inicialmente un préstamo de la casa modelo de la  urbanización ciudad boquia     lo cual fue autorizado.

Nace el instituto docente ciudad boquia en 1992 debido a que fueron adjudicadas nuevas soluciones de vivienda, surge la necesidad de nuevos cupos escolares en la cual se necesita ampliar la planta personal   en donde se permitiera albergar un número mayor de estudiantes. En 1994 y 1996  fue construida la actual planta física mediante un acuerdo con el honorable concejo municipal  y se crea el  colegio ciudad boquia.